230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3872 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 308 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  47.27 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  45.81 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  46.65 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  42.63 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  45.79 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  42.95 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  42.38 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  42.11 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  42.72 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  45.86 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  40.97 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  42.16 
 
 		 290 aa  191  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  44.41 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  36.74 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  34.54 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  39.35 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  37.99 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  37.5 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  37.7 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  33.23 
 
 		 347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  35.81 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  31.17 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  30.52 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.06 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  32.06 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  34.27 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.32 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.04 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.28 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.66 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.05 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  28.17 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  28.17 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.39 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.36 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  30.31 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.61 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  30.16 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  30.26 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.04 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.12 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.33 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.84 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.28 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.33 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.26 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.28 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.21 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.21 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.74 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.12 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.61 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.79 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.66 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>