254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0051 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  100 
 
 
313 aa  610  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  75.81 
 
 
311 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  71.9 
 
 
309 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  69.93 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  69.93 
 
 
309 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  66.45 
 
 
307 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  62.42 
 
 
309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  40.31 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  40 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  39.37 
 
 
316 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  37.35 
 
 
330 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  34.36 
 
 
361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  37.85 
 
 
321 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  33.66 
 
 
318 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  33.23 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.92 
 
 
318 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  33.22 
 
 
313 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  33.98 
 
 
311 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  33.44 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  32.58 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  32.04 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  31.95 
 
 
310 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.79 
 
 
318 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.45 
 
 
312 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  33.01 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.82 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  30.45 
 
 
320 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.9 
 
 
309 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  33.55 
 
 
313 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  33.85 
 
 
319 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.79 
 
 
318 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.45 
 
 
318 aa  122  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.45 
 
 
318 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.97 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  31.1 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  34.94 
 
 
337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  30.6 
 
 
318 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.53 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  32.45 
 
 
372 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  31.21 
 
 
309 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  28.95 
 
 
315 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.53 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.94 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  31.48 
 
 
314 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  31.87 
 
 
367 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.8 
 
 
309 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
315 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.13 
 
 
315 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
313 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.45 
 
 
322 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  32.47 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  29.81 
 
 
318 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  30.58 
 
 
317 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  28.53 
 
 
317 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  33.54 
 
 
377 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.69 
 
 
319 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  31.01 
 
 
340 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  30.62 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.17 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.84 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.69 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  28.15 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  30.09 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.15 
 
 
309 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.75 
 
 
314 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.26 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.51 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.39 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.64 
 
 
315 aa  92.4  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.17 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.81 
 
 
315 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  32.3 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.69 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.75 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  30.51 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  28.05 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  30.23 
 
 
306 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.29 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.67 
 
 
320 aa  86.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.55 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.15 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.02 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.56 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.15 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.83 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.83 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.83 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.71 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  29.22 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.89 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.51 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.39 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  28.96 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  29.78 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>