289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1673 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  100 
 
 		 321 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  49.11 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  42.72 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  31.95 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  32.27 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  31.31 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  31.87 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  31.31 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  34.08 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  31.86 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  31.75 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.21 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  31.95 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.8 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  34.18 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  31.13 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  31.5 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  32.01 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.11 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  32.38 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.06 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  31.45 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  29.14 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.73 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.19 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.25 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  31.91 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.79 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  31.61 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  31.06 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.44 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.88 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  29.3 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  29.3 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.68 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.87 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.68 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.13 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  30.29 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  29.28 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.69 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.36 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.82 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.84 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.9 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.53 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.88 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  29.63 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.9 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  26.65 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.6 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.78 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.09 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  25.47 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>