295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0140 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  100 
 
 		 309 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  59.4 
 
 		 311 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  63.79 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  57.38 
 
 		 311 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  48.68 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  48.01 
 
 		 314 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  50.17 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  50.49 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  49.36 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  48.86 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  48.72 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  48.54 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  44.77 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  43.41 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  45.31 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  35.46 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  29.3 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  33.66 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  33.01 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  31.63 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  32.12 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  32.12 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  31.95 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  30.79 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  32.37 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.19 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  31.25 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.92 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.91 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  33.02 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  32 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  28.53 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.99 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  28.71 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  32.19 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 330 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.87 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.27 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  31.09 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.25 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.54 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.15 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.25 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.82 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.35 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  30.9 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  28.95 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  33 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  33.44 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.51 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.69 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  27.99 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  30.75 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  31.47 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.36 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  26.92 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>