223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4280 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  100 
 
 		 330 aa  631  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  65.94 
 
 		 316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  68.03 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  68.03 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  61.95 
 
 		 337 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  61.92 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  54.52 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  54.39 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  37.35 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  37.34 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  37.15 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  37.15 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  36.88 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  35.85 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  35.46 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  38.44 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.65 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  30.67 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  29.65 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  29.65 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  32.25 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.39 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.34 
 
 		 311 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  29.75 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  29.47 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.62 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.06 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  28.39 
 
 		 320 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  30.2 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 317 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.45 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  31.68 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  29.05 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  32.99 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  29.84 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.35 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.5 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.96 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.96 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.96 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.29 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.89 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.65 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.19 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.14 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  30 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  30.11 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  30.19 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  30.94 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.65 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  30.57 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  27.94 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  29.97 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.73 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.29 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  29.01 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>