270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1105 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  100 
 
 		 320 aa  628  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  97.81 
 
 		 320 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  97.5 
 
 		 320 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  91.56 
 
 		 319 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  86.56 
 
 		 320 aa  557  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  86.88 
 
 		 320 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  86.56 
 
 		 320 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  86.25 
 
 		 320 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  86.56 
 
 		 320 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  65.09 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  58.15 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  60.88 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  57.55 
 
 		 325 aa  338  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  53.14 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  49 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  32.27 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  32.37 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.93 
 
 		 337 aa  158  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.67 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.35 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.19 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.9 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.25 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  28.94 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.7 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.4 
 
 		 316 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.5 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  28.69 
 
 		 361 aa  89.4  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.54 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.1 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.44 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.13 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  24.67 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  22.58 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  25.69 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  23.77 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.5 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.6 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.55 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.64 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  22.68 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.07 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.02 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  22.19 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  21.1 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  25.72 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  26.03 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25.31 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25.78 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  25.8 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>