183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5096 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  100 
 
 		 325 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  70.45 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  69.81 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  69.48 
 
 		 309 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  47.23 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  33.77 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  33.99 
 
 		 315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  34.97 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  33.76 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  32.57 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  35.22 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29.32 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.79 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.9 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.57 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.38 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.73 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  31.41 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.45 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.33 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.33 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  27.45 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.42 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  31.12 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.86 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  34.12 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.99 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.66 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.28 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.94 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.13 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.17 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.91 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.51 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.75 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  27.07 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.23 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  24.46 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  23.32 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  28.35 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  29.05 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  29.05 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.45 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  24.29 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  24.57 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>