258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2804 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  100 
 
 		 322 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  82.86 
 
 		 367 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  70.4 
 
 		 342 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  70.09 
 
 		 342 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  60.98 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  58.86 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  56.96 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  35.96 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.74 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.42 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.56 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  32.8 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  37.17 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  30.38 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.89 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  31.17 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.16 
 
 		 315 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.69 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.22 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.66 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.36 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.11 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.47 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.15 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.26 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.5 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.9 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  30 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.77 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  26.88 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  25.88 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  26.74 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  22.86 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.87 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  22.01 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.36 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25.51 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.62 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  28.94 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.05 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.74 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.32 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.5 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.33 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.33 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>