235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0454 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
315 aa  615  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  65.4 
 
 
316 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  64.44 
 
 
315 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  41.21 
 
 
312 aa  258  7e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  38.1 
 
 
315 aa  230  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  38.59 
 
 
297 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  33.02 
 
 
328 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  36.59 
 
 
314 aa  204  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  33.33 
 
 
321 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  32.62 
 
 
327 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.72 
 
 
306 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.61 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
312 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  27.61 
 
 
310 aa  86.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25.08 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.52 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.25 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.43 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.39 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  22.19 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.43 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  25.72 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.05 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  22.56 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  23.78 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.9 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  22.58 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.28 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  20.93 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  24.29 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.58 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  22.9 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  22.9 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.42 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  23.2 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  22.92 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.75 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  22.3 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  22.3 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.07 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  22.3 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.71 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  23.49 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.51 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.45 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  21.55 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  22.3 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.12 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  28.69 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  24.08 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  28.27 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  24.65 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  21.01 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
318 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  22.73 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  25.16 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  22.91 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  26.12 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.49 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  25.23 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  22.85 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.03 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.09 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.42 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.49 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  23.91 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  24.5 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  24 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  21.75 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  23.11 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  23.25 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  21.97 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.4 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  23.92 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.47 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  25 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  22.6 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  22.81 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  25.63 
 
 
309 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  21.9 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.98 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  22.68 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  24.55 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>