125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1282 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  100 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  76.08 
 
 		 301 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  62.46 
 
 		 301 aa  362  6e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  51.85 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  51.52 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  50.84 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  48.15 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  32.09 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  29.67 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  31.12 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  27.37 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25.5 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  29.89 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  30.7 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  28.18 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  27.91 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  26.9 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  23.11 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  21.35 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  22.8 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.64 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25.71 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.08 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.11 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  26.67 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.73 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  22.31 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  22.05 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.54 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.1 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  22.05 
 
 		 342 aa  49.7  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  21.4 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  21.88 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.4 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  25.45 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  24.15 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  23.25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  20.99 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  20.99 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  22.33 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  21.73 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  24.15 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  24.15 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  21.09 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.21 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  24.48 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  24.54 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.9 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  23.17 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.95 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  21.73 
 
 		 320 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  27.98 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.3 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  21.41 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  21.41 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25.91 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.58 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.02 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>