38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0540 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  100 
 
 
292 aa  564  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  40.83 
 
 
285 aa  209  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  40.83 
 
 
285 aa  208  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  35.48 
 
 
296 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  28.78 
 
 
306 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  26.35 
 
 
302 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  25.52 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  25.52 
 
 
302 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2191  hypothetical protein  27.56 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2426  Auxin Efflux Carrier  27.6 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27.06 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.6 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  31.43 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  21.51 
 
 
302 aa  55.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  24.47 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.54 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.73 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.83 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0291  Auxin Efflux Carrier  28.68 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.47 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  28.38 
 
 
505 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.9 
 
 
304 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1026  putative permease  21.21 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  23.31 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  24.55 
 
 
320 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  22.18 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.38 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.99 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  28.26 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  28.26 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  22.46 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0840  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0605901  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  22.02 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>