28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0840 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0840  auxin efflux carrier  100 
 
 
293 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0605901  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.61 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  26.41 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.3 
 
 
304 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.21 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.89 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.77 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  22.11 
 
 
293 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.64 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  26.76 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  26.63 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.87 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.93 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.79 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.79 
 
 
296 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.04 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.94 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  23.77 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  28.36 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.06 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.47 
 
 
303 aa  42.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>