121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1015 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  580  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  98.35 
 
 
303 aa  574  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  57.33 
 
 
306 aa  347  1e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  63 
 
 
303 aa  346  2e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  55.44 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  51.86 
 
 
301 aa  298  8e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  51.52 
 
 
302 aa  290  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  32.32 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  29.29 
 
 
302 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  31.16 
 
 
298 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  28.07 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  30.82 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  26.04 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  25.69 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.92 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  24.48 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  23.75 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  24.67 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.54 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.06 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  27.67 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  28.69 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  24 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.08 
 
 
317 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.27 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  27.47 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.32 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  28.27 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  30.28 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  25.23 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.81 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.46 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.46 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.58 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  28.64 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 
315 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.64 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.46 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  27.46 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  20.27 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.92 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  24.47 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  24.55 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.61 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  23.71 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.61 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.36 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  26.14 
 
 
314 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.28 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.22 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.44 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.31 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  26.29 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.88 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.44 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.44 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.46 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.84 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.46 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  27.49 
 
 
321 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23 
 
 
314 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  22.28 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  24 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  24 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.45 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  21.7 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.03 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  22.27 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.69 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  24.25 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  28.11 
 
 
306 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  25.54 
 
 
313 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  21.29 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.09 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  21.7 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23.69 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  21.29 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  21.29 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.26 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.35 
 
 
306 aa  46.2  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.04 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  24.77 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  21.29 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.96 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>