218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2072 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  100 
 
 		 297 aa  594  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  59.66 
 
 		 312 aa  381  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  58.59 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  40.68 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  40.54 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  37.29 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  38.14 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  35.33 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  34.82 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  32.55 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 361 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.37 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.04 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.39 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  21.84 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.71 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  23.29 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.37 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.33 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.89 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.27 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.55 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  23.86 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  22.79 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.71 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  25.44 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  23.84 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.6 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  23.63 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  25.22 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.14 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.11 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.43 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  28.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  21.81 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  20.68 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  23.42 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  29.13 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  28.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.12 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  21.23 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.55 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  20.89 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  25 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  23.98 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  21.69 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  19.66 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  27.35 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  20.55 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  20.89 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  21.36 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  23.2 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  23.57 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1194  Auxin Efflux Carrier  26.11 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  21.36 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  22.85 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  22.11 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  22.17 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  22.81 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 291 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  24.19 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.48 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>