162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0469 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 298 aa  577  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  71.14 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  68.46 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  65.1 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  57.72 
 
 		 301 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  50.17 
 
 		 302 aa  265  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  41.55 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  38.59 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  36.91 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  38.08 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  35.91 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  35.91 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  35.57 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  39.46 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  36.24 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  34.9 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  39.22 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  40.69 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  36.52 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  35.57 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.46 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  26.58 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  28.07 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.16 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  26.04 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.04 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.83 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  28.44 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  32.02 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  28.95 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.69 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.78 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.6 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.07 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.26 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  26.34 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  29.59 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.68 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  27.72 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.7 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.36 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.95 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.65 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  21.89 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  22.92 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.08 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.13 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.22 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  25.53 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.49 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  23.26 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  21.48 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  21.9 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.91 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  25.51 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>