85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4411 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  100 
 
 		 301 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  58.72 
 
 		 301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  53.82 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  57.72 
 
 		 298 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  52.49 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  49.66 
 
 		 302 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  38.52 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  39.53 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  38.28 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  37.16 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  37.16 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  37.16 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  37.16 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  39.58 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  38.26 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  37.75 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  38.83 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  35.45 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  33.67 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  39.31 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  30.9 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  29.29 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.12 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.82 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.13 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  26.04 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.04 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.14 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  28.46 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  29.59 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  27.9 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  31.07 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.59 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.47 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.44 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.61 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  29.94 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.83 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  20.65 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  20.79 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  20.19 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  26.94 
 
 		 304 aa  49.3  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.36 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.07 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.75 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  21.97 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.79 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.64 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  21.97 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  22.46 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.73 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  24.2 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  25.97 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.32 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.04 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  23.08 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.94 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  23.29 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.23 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>