125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1387 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 302 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  84.77 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  61 
 
 		 300 aa  341  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  57.24 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  40.34 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  46.05 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  38.08 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  38.59 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  37.37 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  36.64 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  36.14 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  35.45 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  37.23 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  34.52 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  31.62 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  35.59 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.67 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  31.23 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  27.37 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  27.84 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  30.9 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  30.9 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  27.84 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  30.9 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  29.02 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.18 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.47 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.95 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.65 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.79 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  28 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  30.04 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.72 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  28.77 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.39 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25.45 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  24.42 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  25.81 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.23 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.17 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  33.05 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  24.75 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.48 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.3 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.48 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.02 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.74 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.13 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  24.57 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.51 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  27.01 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.62 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  29.27 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  22.3 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  22.3 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.9 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.46 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  26.79 
 
 		 349 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  27.32 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  26.19 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  25.34 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.41 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>