101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0853 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 297 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  54.21 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  50.9 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0520  Auxin Efflux Carrier  35.96 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000302523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  35.29 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.74 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  26.19 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  28.91 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  27.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  21.58 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.17 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  25.74 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  26.37 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  26.12 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  22.74 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  24.23 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.99 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.33 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.4 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  24.73 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.91 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  21.55 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.3 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.47 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  24.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.76 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.57 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.16 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.6 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.28 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.03 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.14 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.3 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  26.29 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.24 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  26.29 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  26.42 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  20.93 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2426  Auxin Efflux Carrier  27.38 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25.87 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25.98 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  22.76 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.55 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  24.56 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.17 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  21.43 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.88 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  27.72 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  22.48 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>