40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0719 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  100 
 
 
285 aa  553  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  99.3 
 
 
285 aa  551  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  42.07 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  28.95 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
306 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2426  Auxin Efflux Carrier  29.15 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.23 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  24.14 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2191  hypothetical protein  27.54 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1026  putative permease  25.58 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.36 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  25.6 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  25.6 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
322 aa  58.9  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  27.89 
 
 
505 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  25.13 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.57 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  27.13 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.74 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.65 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26455  predicted protein  22.08 
 
 
448 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.604877  normal  0.265719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0291  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
317 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.49 
 
 
304 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.28 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.22 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24.62 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  24.62 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  28.79 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.42 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.91 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  22.67 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  26.37 
 
 
299 aa  42.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  29.91 
 
 
296 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>