43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1840 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  81.46 
 
 		 302 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  81.46 
 
 		 302 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1026  putative permease  20.25 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2426  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  31.13 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2191  hypothetical protein  25.36 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26455  predicted protein  19.17 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.604877  normal  0.265719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  22.59 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  21.82 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  20.89 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  22.39 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  20.08 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  25.44 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  24.56 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  24.56 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  20.55 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  24.56 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  24.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  24.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.31 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  24.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  24.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  24.63 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  24.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  24.56 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.07 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  26.32 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  23.5 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  21.96 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  22.75 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  22.75 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>