133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2509 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  99.68 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  99.68 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  99.68 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  99.68 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  99.68 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  99.68 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0249  permease  56.1 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  30.56 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 313 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  32.11 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 319 aa  96.3  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.57 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.84 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  22.74 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.83 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  22.52 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.27 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.13 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.48 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.53 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.88 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  22.92 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  23.59 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.36 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  25.65 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  22.19 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  23.23 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  22.41 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.07 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  22.6 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  23.92 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  24.18 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.36 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  21.66 
 
 		 316 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.4 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  20.31 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 320 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  24.18 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  25.1 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  22.91 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.34 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.55 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.08 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  26.71 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.63 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.51 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  22.41 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  22.41 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  23.72 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  22.15 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  24.56 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  24.74 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  24.6 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  20.93 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  22.7 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  24.55 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  28.47 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.55 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  22.15 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  23.95 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.92 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 299 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  23.91 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  23.37 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  22.19 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>