35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0249 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0249  permease  100 
 
 		 393 aa  785    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  56.1 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  56.1 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  56.1 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  56.1 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  56.1 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  56.1 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  56.1 
 
 		 314 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  56.1 
 
 		 314 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  56.1 
 
 		 314 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  27.75 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  30 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  25 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.85 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.62 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  24.31 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.61 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  23.26 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.64 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.12 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.34 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25.77 
 
 		 321 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 302 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>