244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0295 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  100 
 
 
315 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  50 
 
 
316 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  48.39 
 
 
377 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  42.45 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  35.48 
 
 
313 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  40.58 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  34.84 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  33.98 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.22 
 
 
309 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  31.11 
 
 
313 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  31.58 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.84 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.84 
 
 
309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  30.06 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  30.32 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  30.28 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.19 
 
 
309 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.27 
 
 
309 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  33.2 
 
 
311 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  28.94 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.84 
 
 
310 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  28.85 
 
 
315 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.33 
 
 
317 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  35.2 
 
 
310 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  33.44 
 
 
313 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.75 
 
 
330 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.03 
 
 
313 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.76 
 
 
312 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.43 
 
 
317 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.62 
 
 
340 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
330 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.3 
 
 
315 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.23 
 
 
311 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.55 
 
 
312 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.3 
 
 
318 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  29.16 
 
 
361 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
311 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 
318 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  30.19 
 
 
314 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.37 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  25.24 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.76 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  31.01 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.43 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 
337 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.67 
 
 
319 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.94 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.88 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.43 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.42 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.74 
 
 
320 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  27.5 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.11 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.38 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.67 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.44 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.13 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  29.27 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.93 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.89 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.43 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  30.13 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.18 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  30.67 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.75 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  28.75 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  28.05 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.05 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.44 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.94 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.6 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  26.95 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.76 
 
 
324 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.66 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.57 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.19 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  28.77 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  30.08 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  30.92 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  28.44 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.46 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  29.6 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>