175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0141 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0141  malate permease  100 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  54.63 
 
 		 314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  45.57 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  36.08 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  36.05 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  35.62 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  35.33 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  33.23 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  29.72 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 361 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  23.79 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25.31 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.57 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  27.31 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25.7 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.47 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  27.92 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.51 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.78 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  21.91 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.3 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  22.86 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.24 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  24.84 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  25.33 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.68 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  20 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  19.65 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  25.21 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.88 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.94 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  27.54 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  23.32 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  24.47 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25.15 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.34 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.05 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  23.55 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.22 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  23.67 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.22 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  26.37 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.23 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  22.27 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.12 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  22.83 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.77 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  24.44 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  27.16 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  21.67 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  23.64 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.15 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  21.75 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  21.62 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  22.27 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  23.11 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>