48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1764 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1764  permease  100 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  43.18 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  30.56 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  30.56 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  30.56 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  30.9 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  30.9 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  30.9 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  30.9 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  30.9 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  30.9 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  25.56 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  25.56 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0249  permease  27.75 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  21.18 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  22.61 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.83 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  21.72 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  20.63 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.87 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  22.43 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.85 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.58 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  25.11 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  21.47 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.01 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  22.77 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  21.6 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  20.19 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.45 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  22.19 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  21.7 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  22.01 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>