228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1778 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  100 
 
 
306 aa  579  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  45.36 
 
 
307 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  47.08 
 
 
305 aa  246  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  43.93 
 
 
305 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  37.85 
 
 
310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  35.05 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  34.24 
 
 
306 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  30.91 
 
 
317 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  33.78 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  31.88 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  29.04 
 
 
312 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.38 
 
 
306 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25.68 
 
 
313 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
306 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
315 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.32 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  25.34 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  25 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.71 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23.51 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.8 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  26.28 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.08 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.16 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.16 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  25.68 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.55 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.21 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25.69 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  27.01 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.53 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.53 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.37 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  25 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.53 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30.2 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.58 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  24.84 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  25 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.8 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  24.61 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  26.82 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.93 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.12 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.64 
 
 
320 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  25 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.82 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.82 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  24.24 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  28.62 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.78 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.2 
 
 
313 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.54 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.7 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  25.51 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.34 
 
 
325 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  27.34 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  29.45 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  24.19 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  26.74 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.77 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.23 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  23.31 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.23 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.24 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.44 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>