224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3358 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  100 
 
 		 325 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  69.54 
 
 		 322 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  60.68 
 
 		 320 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  60.99 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  60.99 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  60.68 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  59.01 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  56.52 
 
 		 320 aa  349  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  57.23 
 
 		 320 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  57.55 
 
 		 320 aa  348  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  57.85 
 
 		 322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  56.36 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  55.03 
 
 		 319 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  54.83 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  47.67 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.21 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.75 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  31.61 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.99 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.8 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.84 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  31.65 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  26.43 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.21 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.81 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.09 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.04 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 311 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  29.06 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.55 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  22.7 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  29.36 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.39 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.84 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  25.88 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.84 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  24.08 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.02 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  24.6 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.86 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.11 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  26.93 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  23.72 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.35 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  24.6 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  26.44 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.25 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.26 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  26.48 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.96 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  28.26 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.41 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.16 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  29.38 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  24.85 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  25.23 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  23.81 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  25 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  22.44 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  28.1 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  23.62 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  20.94 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  26.02 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.3 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>