232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1027 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  100 
 
 		 315 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  49.52 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  49.52 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  49.52 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  49.2 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  49.2 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  48.87 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  48.87 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  47.59 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  46.3 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  45.54 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  44.76 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  44.75 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  47.2 
 
 		 325 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  42.9 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  31.47 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  31.79 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.43 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.57 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.81 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  34.89 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  34.89 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 330 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.43 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  32.04 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 311 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 320 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 309 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.1 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.51 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.85 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.17 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  23.53 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.35 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  32.39 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.89 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  31.94 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.65 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.2 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.4 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  29.02 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.47 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.78 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  30.94 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  28.99 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  24.15 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.89 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.96 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.22 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.24 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.05 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.71 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.71 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.21 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.02 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.58 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  29.03 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  31.09 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.21 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  28.73 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.67 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  28.34 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  22.7 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  24.55 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  24.29 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.47 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>