280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1044 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  100 
 
 		 322 aa  627  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  66.25 
 
 		 320 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  65.62 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  66.25 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  66.25 
 
 		 320 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  65.09 
 
 		 320 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  63.75 
 
 		 320 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  64.47 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  64.78 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  63.52 
 
 		 319 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  62.31 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  58.51 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  57.85 
 
 		 325 aa  340  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  53.89 
 
 		 322 aa  262  6e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  45.21 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  34.08 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  30.35 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.98 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.67 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.84 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  32.91 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.6 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  30.03 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  33.01 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.6 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.7 
 
 		 372 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.25 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.73 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.1 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.16 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  28.37 
 
 		 327 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.71 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.39 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.48 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 309 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.98 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.78 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  29.78 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.73 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.13 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.01 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  27.19 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.64 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.78 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.91 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  26.09 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  28.35 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  21.65 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.38 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  27.23 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  21.17 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  25.14 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  24.17 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  22.15 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  22.15 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  25.93 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.23 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  21.61 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  23.25 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  22.9 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.4 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>