258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3295 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  100 
 
 		 320 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  98.75 
 
 		 320 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  97.81 
 
 		 320 aa  620  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  98.44 
 
 		 320 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  90.31 
 
 		 320 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  86.56 
 
 		 320 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  85.62 
 
 		 320 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  85.62 
 
 		 320 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  81.88 
 
 		 319 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  65.62 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  62.42 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  61.51 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  60.99 
 
 		 325 aa  359  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  54.72 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  48.33 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  34.08 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.93 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.67 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.33 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.06 
 
 		 313 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.38 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.04 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.17 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.92 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.71 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24.41 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  28.19 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  28.4 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.41 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.47 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.53 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.69 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.79 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.57 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  25.99 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.88 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.28 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  24.14 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.95 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  25.69 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.01 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.22 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  21.47 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  27.25 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  27.32 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.72 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  23.18 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  23.02 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.04 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.71 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  25.55 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  22.36 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>