210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0537 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  100 
 
 
313 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  35.14 
 
 
316 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  35.78 
 
 
316 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  37.71 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  35.22 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  34.88 
 
 
313 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  35.76 
 
 
313 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  34.55 
 
 
315 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  39 
 
 
318 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  35.55 
 
 
313 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  34.5 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  36.93 
 
 
316 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  33 
 
 
313 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  37.67 
 
 
330 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  35.76 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  35.1 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  34.71 
 
 
318 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  35.62 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  34.55 
 
 
319 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  35.27 
 
 
318 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  34.36 
 
 
318 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  35.27 
 
 
318 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  34.36 
 
 
318 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  34.36 
 
 
318 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  34.93 
 
 
318 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  34.14 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  36.3 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  33.78 
 
 
318 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  32.09 
 
 
318 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  40.26 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  37.54 
 
 
318 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  39.93 
 
 
318 aa  145  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  39.93 
 
 
318 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  36.45 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  34.96 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.3 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  29.69 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  32.65 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  32.98 
 
 
295 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  30.2 
 
 
307 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  33.21 
 
 
302 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.18 
 
 
309 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  31.8 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.75 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.3 
 
 
310 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  29.03 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  29.35 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  25.67 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  30.98 
 
 
308 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  29.02 
 
 
362 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.4 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.9 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  30.69 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  31 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  27.18 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  29.56 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  33.17 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  26.52 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  26.52 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.16 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.23 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.22 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  27.56 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  23.59 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  27.07 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  23.61 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  25.58 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  25.72 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  25.95 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  26.78 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  25.7 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.99 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  27.72 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.28 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  27.39 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  28.91 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.26 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  33.5 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.49 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.6 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.19 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.71 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  26.52 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  29.86 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  31.92 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>