216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0262 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  100 
 
 		 299 aa  569  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  49.32 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  51.36 
 
 		 312 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  45.45 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  42.27 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  38.98 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  41.02 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  39.45 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  39.79 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  39.2 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  43.42 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  40.61 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  39.09 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  39.32 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  40.71 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  39.26 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  40.68 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  35.71 
 
 		 310 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  35.69 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  34.84 
 
 		 339 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  35.64 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  40.14 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  36.08 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  39.67 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  35 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  35 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  37.33 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  38.16 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  36.45 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  35.57 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  34.03 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  41.43 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  35.53 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  39.72 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  34.97 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  37.41 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  37.68 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  37.32 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  35.86 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  37.28 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  37.72 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  37.67 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  35.07 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  37.33 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  34.6 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  34.9 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  35.36 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.68 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  34.17 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  34.24 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  38.16 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  31.27 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  29.07 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  28.01 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  30.45 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.77 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.92 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.94 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  28.82 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.87 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  27.72 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.82 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  28.05 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  29.1 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  29.07 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  26.4 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.52 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30.74 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  26.95 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  34.06 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  25 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>