161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3921 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  100 
 
 		 315 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  54.75 
 
 		 308 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  49.35 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  44.04 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  41.86 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  40.06 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  41.69 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  40.6 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  39.14 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  42.71 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  37.22 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  37.54 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  42.96 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  41.38 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  38.06 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  40.34 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  40.69 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  40.69 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  40.69 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  39.79 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  39.45 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  36.74 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  37.25 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  35.43 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  31.27 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  38.91 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  41.11 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  38.61 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  37.67 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  34.43 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  35.97 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  35.55 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  36.21 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  36.67 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  39.31 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  35.88 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  35.79 
 
 		 350 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  38.26 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  31.7 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  31.7 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  32.9 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  31.15 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  31.05 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  32.25 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  31.92 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  31.92 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  30.89 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  31.92 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  33.12 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  32.89 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  32.57 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  32.19 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  32 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  29.87 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  29.01 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  33.11 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  29.35 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  32.13 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.3 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  29.53 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.8 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  28.25 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  27.92 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.83 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  30.88 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  27.3 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  29.85 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  34.07 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  30.26 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.14 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.45 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  28.43 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  28.88 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.43 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>