194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1479 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  68.4 
 
 
311 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  46.89 
 
 
305 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  46.23 
 
 
305 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  46.56 
 
 
305 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  46.23 
 
 
305 aa  255  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  45.9 
 
 
305 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  45.9 
 
 
305 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  45.25 
 
 
305 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  45.04 
 
 
305 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  44.68 
 
 
305 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
302 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  29.57 
 
 
297 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.78 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  28.83 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  28.12 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  24.64 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  25.67 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  26.61 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  24.67 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.97 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.51 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  25.35 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  26.23 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25.24 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.55 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.34 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.34 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  24.67 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  24.01 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  24 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 
291 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.73 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  25.45 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  29.67 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  23.7 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  24.01 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  24.57 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  24.48 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.93 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.34 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.47 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  25.65 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.38 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  21.97 
 
 
315 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.2 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  23.67 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  22.92 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.69 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  23.23 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.47 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  23.1 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  20.86 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.05 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  22.44 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  19.8 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.69 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.41 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.65 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.08 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  22.73 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  23.7 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.43 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.14 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.99 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.34 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  21.45 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  20.52 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  21.82 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  22.52 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.36 
 
 
296 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>