192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0363 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  100 
 
 		 307 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  93.4 
 
 		 303 aa  501  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  57.63 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  50.84 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  32.14 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  32.23 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  33.22 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  31.94 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  32.89 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  35.31 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  31.29 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  31.19 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  30.1 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.07 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  34.29 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  30.84 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.15 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  32.68 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.53 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  26.52 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  29.31 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.09 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  31.8 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  24.38 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  24.38 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  28.46 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  28.91 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  30.94 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  32.34 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  22.65 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.52 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  28.34 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.18 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  28.81 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  30.3 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  27.21 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.78 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.38 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  25.47 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  31.4 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.05 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  24.82 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.93 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.39 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  30.28 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.26 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  28.14 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.67 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>