200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  96.95 
 
 
295 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  55.67 
 
 
291 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  60.69 
 
 
296 aa  316  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  54.64 
 
 
291 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  50.86 
 
 
291 aa  291  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  53.26 
 
 
291 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  52.92 
 
 
291 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  50.72 
 
 
291 aa  271  9e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  35.66 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  37.98 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  37.8 
 
 
293 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  37.68 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  37.68 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  36.97 
 
 
295 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  30.17 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
294 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  30 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  30.14 
 
 
293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  28.72 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  27.59 
 
 
295 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  27.99 
 
 
293 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  26.62 
 
 
304 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  28.81 
 
 
292 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  26.39 
 
 
295 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  28.77 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  33.94 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.16 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.4 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  29.41 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  28.04 
 
 
301 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.83 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  29.51 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.94 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  28.9 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  28.96 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.26 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  27.91 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.19 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  31.47 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  29.23 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.34 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.41 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  29.77 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  29.17 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  20.36 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.72 
 
 
314 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.09 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.79 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  27.05 
 
 
306 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.33 
 
 
318 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.02 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.54 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  28.88 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30.11 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.62 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.62 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.29 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  25.11 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.61 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  27.01 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.54 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  25.77 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  26.58 
 
 
316 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.4 
 
 
309 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  24.88 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24.88 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  31 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.36 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  31 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  30 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.36 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  27.8 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.34 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.69 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>