292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0069 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  100 
 
 		 293 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  54.27 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  38.97 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  37.28 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  36.59 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  37.68 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  35.46 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  39.03 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  36.33 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  37.8 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  37.8 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.32 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.32 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  31.51 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  30.6 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  32.66 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  31.83 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  33.55 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  26 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  28.14 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  28.38 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  30.05 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.84 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  29.41 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  34.02 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.81 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.58 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  29.62 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.25 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  28.63 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.05 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.33 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.51 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  28.71 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  27.03 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.03 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.41 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.43 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.53 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.2 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.72 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.37 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.62 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  25.45 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  26.19 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  33.12 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  22.12 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.47 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.95 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  28.88 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.25 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.1 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  26.93 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  23.04 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  23.85 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>