146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0290 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  100 
 
 		 294 aa  558  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  42.16 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  41.5 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  41.46 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  41.11 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  40 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  36.24 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  37.98 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  36.75 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  38.33 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  36.96 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  36.4 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  36.4 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  35.69 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  33.81 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  31.36 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  31.51 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  27.49 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  27.96 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  29.72 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  30.24 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  24.57 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  31.16 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 297 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  32.33 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  30.46 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  30.05 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.71 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.74 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  30.99 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.16 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  27.49 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  32.67 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  25.8 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.53 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.53 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  30.92 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  31.14 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  24.9 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 367 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  27.81 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  32.46 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  29.23 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.89 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.71 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.7 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.14 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.14 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  26.7 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  32.89 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.14 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.37 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  28.1 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.38 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  28.84 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>