273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1589 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
297 aa  564  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  61.41 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  45.05 
 
 
301 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  43.3 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  43.3 
 
 
297 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  42.95 
 
 
302 aa  235  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  42.03 
 
 
302 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  32.51 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
291 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  32.76 
 
 
291 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  31.63 
 
 
291 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  30.95 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  32.71 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  31.83 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  36.88 
 
 
310 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  34.4 
 
 
307 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  30.9 
 
 
307 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  32.19 
 
 
322 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.33 
 
 
319 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  31.69 
 
 
310 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  31.07 
 
 
302 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  26.8 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  29.31 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  31.65 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  27.21 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  29.07 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  35.31 
 
 
307 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  28.14 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  31.54 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  31.68 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  27.82 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  32.12 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  27.82 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  28.04 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  26.76 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  29.32 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  27.05 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  27.46 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  27.11 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  38.79 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.8 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  26.76 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  26.76 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  26.52 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  34.13 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.46 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  26.52 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  25.93 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  35.42 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.19 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  34.6 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.19 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.19 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  29.1 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.86 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.52 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  33.65 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.01 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  25.34 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.91 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  29.47 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.98 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.83 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.89 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  27.11 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  26.52 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.5 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.42 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  31.48 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.14 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  31.14 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.64 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.67 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.37 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  29.51 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.48 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  29.51 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.12 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.52 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.52 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.62 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.92 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.87 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  27.14 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>