185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0205 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  100 
 
 		 295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  56.79 
 
 		 291 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  46.44 
 
 		 295 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  45.45 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  48.06 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  45.89 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  43.71 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  41.75 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  38.33 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  36.59 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  38.16 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  31.76 
 
 		 295 aa  129  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  29.51 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  31.94 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29.82 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.79 
 
 		 302 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.07 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  27.24 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  28.28 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  28.04 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  24.39 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  28.23 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  24.64 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  28.04 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  27.51 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.88 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  25.18 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  27.89 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  26.98 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  26.98 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.86 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.65 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.4 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.83 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.38 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.98 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.74 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.41 
 
 		 311 aa  53.1  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.62 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  24.3 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.18 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  22.45 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.51 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 325 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.93 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  27.5 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.02 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30.22 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  22.88 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.39 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.91 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>