178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2787 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
311 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  68.4 
 
 
307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  239  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  42.62 
 
 
305 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  42.3 
 
 
305 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  42.91 
 
 
305 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  42.91 
 
 
305 aa  235  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
302 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
325 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  27.37 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  25.43 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  25.76 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.99 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  28.23 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  30.14 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  26.73 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  27.43 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.64 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.22 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  22.46 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  24.15 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  23.99 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  25.76 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  23.38 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  23.84 
 
 
304 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.75 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.64 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  21.43 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.36 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  21.5 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  22.67 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  21.74 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  22.97 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 
301 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  22.97 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  22.97 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.11 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  21.09 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  23.19 
 
 
362 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  22.15 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  22.64 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  22.97 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.54 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.64 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  22.64 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.84 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  20.75 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  22.3 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  21.09 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.64 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  22.88 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.58 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.67 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.23 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.19 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  21.48 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  25 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  21.11 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  22.03 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  22.95 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25.68 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  21.23 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
302 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.23 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  20.41 
 
 
313 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
311 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.17 
 
 
315 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  22.3 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  23.62 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.33 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.39 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.18 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.56 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.17 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  21.54 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  21.64 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  35.25 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  24.45 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>