192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0492 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  100 
 
 
304 aa  591  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  91.06 
 
 
307 aa  549  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  90.1 
 
 
304 aa  534  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  79.07 
 
 
301 aa  484  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  55.41 
 
 
309 aa  318  7e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.99 
 
 
302 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  30.93 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.63 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.97 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  29.32 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
315 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  26.3 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
305 aa  85.9  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  24.17 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  28.57 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  28.25 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.73 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25.75 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  26.54 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  25.64 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.74 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.78 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.03 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  28.84 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.03 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  24.42 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  26.29 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  26.73 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.96 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.54 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.16 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  24.83 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  25.85 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  26.32 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  25.32 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  24.27 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  29.13 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  24.23 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  25.69 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  21.79 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.74 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25 
 
 
321 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 
312 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  23.05 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  31.12 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
308 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  27.42 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  29.73 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  26.15 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  26.29 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  25.18 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  26.11 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  26.51 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  23.21 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  26.51 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  25.86 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.58 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0840  auxin efflux carrier  24.3 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0605901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  25.69 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  23.4 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  25.67 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  30.59 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  23.62 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  21.31 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.07 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.55 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  25.91 
 
 
295 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  23.27 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  23.14 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.51 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  25.9 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  22.01 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  27.04 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  22.65 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  21.59 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>