193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2040 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  57.34 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  56.14 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  45.45 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  47.06 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  43.88 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  43.32 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  43.66 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  35.66 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  34.27 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  36.52 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  35.41 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  32.52 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  34.52 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  33.83 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  30.36 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  32.66 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  27.56 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 326 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  31 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  31.32 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  32.86 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.55 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.55 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  26.21 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.4 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  31.19 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  31.35 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  31.48 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.22 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.07 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.2 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.54 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.3 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.52 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  32.84 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.52 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  29.61 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  26.65 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  24.07 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.56 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.53 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 322 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.44 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  24.88 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  21.33 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.08 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.46 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.26 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  28.22 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.78 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  27.45 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  24.92 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.5 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  23.21 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  33.64 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>