112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0947 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  54.92 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  37.67 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  30.64 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  31.12 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  29.82 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  29.97 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  35.54 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  27 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.35 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.35 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  27.04 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  26.46 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  24.04 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.39 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.79 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  24.81 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  23.57 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  26.53 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.26 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  23.3 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.88 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  23.38 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  24.4 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  24 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  22.34 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.73 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  22.97 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  22.95 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  21.58 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  22.93 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  22.11 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.67 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  23.71 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  23.33 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.55 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  23.4 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  21.94 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  22.34 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.6 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  23.25 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  23.84 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  22.77 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  22.67 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  19.34 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.2 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  21.36 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  22.38 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  20.39 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.04 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  22.64 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  19.51 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.51 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  22.92 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  28 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  21.23 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  20.14 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  20.45 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  23.24 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  22.33 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.27 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  22.52 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23.5 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  30.69 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  22.65 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  21.57 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  22.65 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>