104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1252 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  100 
 
 		 361 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  45.69 
 
 		 325 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  32.42 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  28.75 
 
 		 307 aa  126  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  31.25 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  25.15 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.86 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 305 aa  99.8  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.92 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.06 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.6 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  29.51 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.38 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25.47 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  24.53 
 
 		 321 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.26 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  22.22 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.53 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.09 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.92 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.46 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.61 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  23 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  26.13 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  23.21 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  23.21 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.55 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  20.14 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  21.27 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  21.7 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  21.3 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 308 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.45 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.48 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  22.32 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  21.58 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1194  Auxin Efflux Carrier  23.29 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  21.34 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  21.49 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  23.79 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 		 587 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  31.51 
 
 		 587 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  31.45 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  22.19 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  22.19 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  25.3 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.52 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  22.88 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.09 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  24.71 
 
 		 350 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.19 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  22.86 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  23.65 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.33 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.8 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  21.67 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.08 
 
 		 302 aa  46.2  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  22.46 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.34 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  22.46 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  21.61 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  22.46 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  21.6 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  22.13 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  22.47 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.81 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  24.68 
 
 		 302 aa  43.9  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  21.23 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.14 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  22.13 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>