72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5541 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 307 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  25.45 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  25.34 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  21.75 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  25.68 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  23.33 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.48 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  22.15 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  22.48 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.12 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  23.66 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  20.91 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 		 326 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.74 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  25.79 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  22.93 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  19.51 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  20.91 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  19.51 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25.71 
 
 		 297 aa  52.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  20.49 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.36 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  19.51 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.08 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  21.03 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  19.66 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  19.86 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  22.18 
 
 		 301 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.74 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  21.47 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  23.43 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.58 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.98 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.92 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  20.52 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  24.37 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.86 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.19 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  20.68 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  24.88 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  22.07 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  23.87 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.99 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.31 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  28.93 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.96 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.12 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  23.23 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  22.17 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  22.77 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  25.21 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  25.21 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  21.67 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  29.06 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  22.93 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  23.91 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  22.52 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.38 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  21.61 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  22.87 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>