58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0393 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  100 
 
 
309 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  36.14 
 
 
309 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  36.65 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  35.07 
 
 
303 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  30.88 
 
 
301 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  27.56 
 
 
309 aa  148  9e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  33.57 
 
 
308 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  30.88 
 
 
305 aa  132  9e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  28.87 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  32.11 
 
 
304 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  23.83 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  23.83 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  23.16 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.36 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  23.16 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  22.74 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  24.37 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  23.1 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  23.1 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  23.1 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  23.1 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  23.21 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  32.04 
 
 
290 aa  63.5  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  25.93 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  27.09 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  30.37 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
293 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.89 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.33 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.89 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  21.16 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.34 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.65 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.84 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  28.91 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  24.45 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.92 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  23.16 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.14 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.08 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.76 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  26.79 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.72 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  21.98 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.62 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  25.4 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  33.04 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25 
 
 
313 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  22.22 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>