61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05181 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  100 
 
 
307 aa  587  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  50.99 
 
 
305 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  49.01 
 
 
305 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  48.68 
 
 
305 aa  275  6e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  45.21 
 
 
304 aa  215  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  46.08 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  38.37 
 
 
261 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  37.76 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  38.52 
 
 
261 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  38.17 
 
 
261 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  26.49 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  25.16 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.86 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  28.1 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  26.61 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  29.91 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.03 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.54 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.2 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.34 
 
 
315 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.47 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.9 
 
 
316 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.27 
 
 
312 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 
307 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.43 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.19 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.32 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.62 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  24.71 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.75 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.87 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  36.67 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  24.07 
 
 
291 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.59 
 
 
319 aa  45.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  23.7 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.23 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  25.47 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.44 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.08 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  28.27 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.1 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  22.68 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  18.14 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.24 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.08 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.8 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  25.12 
 
 
299 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.92 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  22.52 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  21.26 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  36.99 
 
 
299 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  23.04 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.99 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>