295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0121 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  100 
 
 
305 aa  590  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  42.57 
 
 
307 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  43.93 
 
 
306 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  38.69 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  41.5 
 
 
310 aa  209  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  37.83 
 
 
312 aa  192  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  33.78 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  32.18 
 
 
317 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  33.11 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  30.03 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.43 
 
 
313 aa  112  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
307 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.99 
 
 
306 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  26.8 
 
 
309 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.55 
 
 
361 aa  99.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  29.54 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  26.79 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.85 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  26.99 
 
 
327 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.61 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.92 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.14 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
304 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  26.2 
 
 
328 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.12 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  35.96 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.33 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.5 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23.34 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  21.79 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.46 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.96 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.55 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.19 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.59 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  30.79 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  21.12 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  28.37 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.6 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.67 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  21.62 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.16 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  27.8 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.8 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  23.66 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.23 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.75 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.81 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  32.77 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  23.51 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  23.51 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  26.79 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.82 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  28 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  31.12 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  27.88 
 
 
295 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  29.33 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.75 
 
 
315 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  22.79 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
320 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  24.45 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.64 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  26.92 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.44 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.24 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  30.05 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.75 
 
 
311 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.14 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.24 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.14 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.1 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.27 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  22.97 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.27 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  26.99 
 
 
299 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  24.27 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  24.58 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.42 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.58 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>