212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2049 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  100 
 
 		 305 aa  591  1e-168  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  43.61 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  47.08 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  38.69 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  38.55 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  39.67 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  34.35 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  29.28 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  31.48 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.97 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  30.14 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.9 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  27.52 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  27.4 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  24.46 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  24.46 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.64 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  23.79 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.05 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  25.84 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.18 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.2 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.9 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.67 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  24.69 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  22.57 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  21.94 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.54 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  29.26 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.45 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.42 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  30.93 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  26.55 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  27.24 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.65 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.24 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.24 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.6 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.27 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  27.75 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  32.61 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  24.12 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  24.12 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  29.67 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  22.48 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  22.48 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.48 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.53 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.46 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.56 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  28.23 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  25.17 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  24.37 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  27.48 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>